Dalam rangka meningkatkan pelayanan puskesmas kepada masyarakat, Aplikasi Jogja Smart Service (JSS) memberikan fasilitas Layanan Umum Antrian Puskesmas. Antrian Puskesmas dapat diakses oleh seluruh warga Kota Yogyakarta dengan cara mengunduh Aplikasi JSS (Jogja Smart Service) di Playsore pada telepon seluler berbasis android. 

Tujuan dari layanan pendaftaran online yaitu mempermudah warga yang akan berobat ke puskesmas agar tidak terlalu lama dalam mengantri untuk mendapatkan nomor antrian pemeriksaan.

Adapun pendaftaran melalui Antrian Puskesmas dilakukan satu hari sebelum tanggal periksa. Langkah yang dilakukan untuk melakukan pendaftaran melalui Antrian Puskesmas, yaitu :

1. Klik menu Antrian Puskesmas
2. Pilih Puskesmas dan Klinik yang dituju
3. Pilih tanggal yang dituju
4. Lengkapi formulir yang disediakan
5. Lampirkan dokumen yang diminta
6. Klik Daftar

Setelah melakukan pendaftaran, maka petugas akan melakukan verifikasi data pasien dan memberikan balasan yang berisi nomor antrian pasien pada jam kerja. 

Selain mendaftarkan diri sendiri, pemilik akun JSS (Jogja Smart Service) juga dapat mendaftarkan anggota keluarga yang lain dalam satu KK.